Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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