Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms