Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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