Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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