Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Urb2E9Q7L1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms