Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms