Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc170D3YXL0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms