Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspp1B2RX88 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms