Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Usf3B2RUQ2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Usf3B2RUQ2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms