Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palm3A2TJV2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palm3A2TJV2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms