Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Myom3A2ABU4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Myom3A2ABU4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms