Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Gm30173-201ENSMUST00000195035 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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