Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Tnnt3Q9QZ47 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Tnnt3Q9QZ47 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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