Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmQ9QXG2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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