Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tmod4Q9JLH8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tmod4Q9JLH8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod4Q9JLH8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms