Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms