Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgn5Q9JL35 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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