Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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