Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms