Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms