Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr53Q9DB94 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms