Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnpy3Q9DAU1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnpy3Q9DAU1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms