Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rep15Q9D7T1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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