Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf225Q9D7D1 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf225Q9D7D1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf225Q9D7D1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf225Q9D7D1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf225Q9D7D1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf225Q9D7D1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf225Q9D7D1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf225Q9D7D1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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