Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms