Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms