Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrs1Q9CYH6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms