Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BccipQ9CWI3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BccipQ9CWI3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms