Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PompQ9CQT5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PompQ9CQT5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PompQ9CQT5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PompQ9CQT5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PompQ9CQT5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PompQ9CQT5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PompQ9CQT5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PompQ9CQT5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PompQ9CQT5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms