Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms