Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsmce3Q9CPR8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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