Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Mrpl43Q99N89 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Mrpl43Q99N89 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms