Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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