Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Smim11aQ99J19 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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