Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms