Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb6Q922F4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms