Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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