Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms