Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms