Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin9Q8C735 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin9Q8C735 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin9Q8C735 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin9Q8C735 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin9Q8C735 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin9Q8C735 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lin9Q8C735 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lin9Q8C735 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lin9Q8C735 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lin9Q8C735 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lin9Q8C735 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lin9Q8C735 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lin9Q8C735 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms