Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms