Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem87bQ8BKU8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms