Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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