Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms