Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms