Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp3Q7TNH6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms