Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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