Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssx9Q6XAS3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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