Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms