Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf1Q6PDM2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms